中藥材的超微粉碎機存在的問題不易受力中藥材中大多數是植物，其種類繁多，性質不一，有相當一部分富含纖維且比重較輕，在粉碎機械之中不易受到機械力的作用，使用者往往有“鐵錘打棉花”的感慨。溫度過高中藥材多數具有活性成分，在粉碎處理當中，對溫度有著較高的要求，如果一味追求高轉速所帶來的沖擊力，往往造成溫度過高，藥材失效。
破壁效果不好中藥材的細胞直徑一般在10至50微米之間，一部分達到70微米，所以粉碎到兩三百目，僅僅有部分細胞開始破壁，要達到以提高藥效為目的的破壁，應該將細度底線設定到500目(等比直徑25微米)左右才比較合適。
而現在的一般性超微粉碎機對于中藥材都很難達到這一要求。使用成本高當前一般性超微粉碎機應用于中藥材時，如果追求較好的粉碎效果，就需要反復粉碎，無法實現良好的生產效率或成本。速度快，可低溫粉碎，超微粉碎技術采用常溫物理機械研磨、超音速氣流粉碎、冷漿粉碎等方法,在粉碎過程不會產生局部過熱現象尤其是超微粉碎機，甚至可在低溫狀態下進行，粉碎瞬時即可完成，因而能zui大限度地保留粉體的生物活性成分，有利于制成所需的高質量產品。
粒徑細，分布均勻，超微粉碎在原料上外力的分布是很均勻的。分級系統的設置，既嚴格限制了大顆粒，又避免了過碎，得到粒徑分布均勻的超細粉，同時很大程度上增加了微粉的比表面積，使吸附性、溶解性等亦相應增大。節省原料，提高利用率，物體經超微粉碎后，超微粉一般可直接用于制劑生產，而用常規粉碎方法得到的產物，仍需一些中間環節才能達到直接用于生產的要求，這樣很可能會造成原料的浪費。
因此，該技術尤其適合原料（如靈芝孢子粉）的粉碎，也適合于中藥超微粉碎。減少污染，超微粉碎是在封閉系統內進行的，既避免了微粉污染周圍環境，又可防止空氣中的灰塵污染產品，在食品及醫療保健品中運用該技術，可控制微生物和灰塵的污染。提高發酵、酶解過程的化學反應速度，由于經過超微粉碎后的原料，具有大的比表面,在生物、化學等反應過程中。
反應接觸的面積大大增加了，因而可以提高反應速度，在生產中節約了時間，提高了效率。利于機體對食品營養成分的吸收，經過超微粉碎的食品，由于其粒徑非常小，營養物質不必經過較長的路程就能釋放出來，并且微粉體由于小而更容易吸附在小腸內壁，這樣也加速了營養物質的釋放速率，使食品在小腸內有足夠的時間被吸收。